甘肃二类医疗器械经营许可证是企业在甘肃省从事第二类医疗器械销售、储存、配送等经营活动必须取得的法定资质。根据《医疗器械监督管理条例》及甘肃省药品监督管理局相关规定，经营第二类医疗器械需依法办理备案手续。

申请条件主要包括：企业具备与经营规模相适应的经营场所和贮存条件，经营场所面积一般不少于30平方米，库房面积不少于20平方米（部分可不设库房，实行委托储运）；具有与其经营产品相适应的质量管理制度和技术人员；企业负责人或质量负责人需具备相关专业背景或经过培训并取得合格证明。

申请流程如下：首先在甘肃省政务服务网或国家药品监督管理局“医疗器械生产经营许可备案信息系统”注册账号，填写备案信息，上传材料，包括营业执照副本、经营场所产权或租赁证明、组织机构图、人员简历及学历/职称证明、质量管理制度文件等。提交后由所在地市级市场监管部门进行资料审核，符合条件的予以备案，并发放《第二类医疗器械经营备案凭证》，相关信息向社会公示。

需要注意的是，二类医疗器械经营实行备案管理而非许可审批，但监管要求严格。企业需建立进货查验、销售记录、不合格品处理等制度，确保产品可追溯。若涉及特殊类别如角膜接触镜、助听器等，还需满足特定服务要求，如配备专业验配人员。

备案完成后，企业应接受日常监督检查，若变更企业名称、法定代表人、经营地址、经营范围等信息，须在变更后30日内办理备案变更。未按规定备案或超范围经营的，将面临行政处罚。

总体而言，甘肃二类医疗器械备案程序便捷高效，但企业必须依法合规运营，保障医疗器械质量安全。建议提前咨询当地市场监管部门或专业服务机构，确保材料齐全、流程顺利。