截至2024年，中国对第二类医疗器械的增值税税率适用一般规定：销售或进口第二类医疗器械，增值税税率为13%。该税率适用于一般纳税人，按照《中华人民共和国增值税暂行条例》及相关政策执行。

需要注意的是，若为小规模纳税人，销售医疗器械适用3%的征收率，目前根据国家阶段性税收优惠政策，可能享受减按1%征收的优惠（如2023年至2024年延续的政策），具体需结合当年最新税务公告执行。

此外，第二类医疗器械在生产、经营环节需取得药监部门备案或许可，但税收政策与其监管类别无直接关联，主要依据商品的增值税税目归类确定税率。医疗器械通常归入“医疗器材”类，统一适用13%的增值税税率。

对于出口的第二类医疗器械，若符合出口退税条件，可享受增值税“免抵退”政策，退税率依据具体产品而定，一般为13%，有助于企业降低出口成本。

还需关注地方性税收扶持或产业园区优惠政策，部分区域对医疗器械企业有企业所得税减免、增值税地方留存返还等支持措施，但这些不属于全国统一税率范畴。

综上，第二类医疗器械当前主要增值税税率为13%（一般纳税人），小规模纳税人按3%征收率或阶段性优惠税率1%执行。建议企业结合自身纳税人身份，并参考国家税务总局及财政部发布的最新文件（如2024年增值税政策调整通知）进行合规申报。如有特殊业务场景（如研发服务、跨区域销售等），应咨询专业税务机构以确保准确适用税率。